六安市农业科学研究院为正处级公益一类事业单位，加挂“安徽省农业科学院六安果树产业发展研究中心”牌子，始建于1958年。主要是从事小麦、水稻、油菜、麻类（大麻、红麻）、果树、茶叶、中草药、蔬菜等作物品种筛选、栽培、土肥、植保等方面的应用性研究和农业集成创新技术试验示范、展示等工作。聚焦农业供给侧改革，落实国家藏粮于地、藏粮于技战略。把握产业发展需求重点，凝炼地方农业产业发展关键技术课题开展研究工作。

六安市农业科学研究院核定事业编制72人，实有在编人员60人，核定领导班子职数6人，其中正处级职数（党组书记兼任院长）1名，党组成员兼任副院长3名，纪检组长、总农艺师各1名；核定正科级职数14名，副科级职数6名，其中室主任（正科级）11名，副总农艺师2名，纪检副组长1名，室副主任（副科级）6名。内设机构11个，其中院办公室、试验基地管理办公室2个管理服务职能科室，油菜作物研究室、小麦作物研究室、水稻作物研究室、麻类作物研究室、动物科学研究室、果树产业研究室、中药材产业研究室、蔬菜产业研究室、茶业研究室等9个专业研究室。现有中高级以上专业技术人员41人，其中研究员4人，副研究员8人。

院拥有集办公、科研、培训、农产品检验为一体的农业科技大厦29层，建筑面积4.4万平方米，是农业科研综合平台，是六安“三农”工作综合服务中心，也是市政府第三办公区（租用）。

六安市农业科学研究院试验示范基地分别位于六安市金安区木厂镇卅铺村和金安区稻麦良种场境内，占地总面积近千亩。综合管理楼2000余平方米，低温种质库3000平方米。院拥有农业部设立的现代农业产业技术体系油菜综合试验站、小麦综合试验站、大麻红麻综合试验站、国家水稻核心品种展示中心等国家级科技创新平台和安徽省现代农业产业技术体系水稻、特色产业、油料、茶叶、果树产业、乡村产业经济6个综合试验站和蔬菜岗位专家省级创新平台。

六安市农业科学研究院建院以来科研成果颇丰，先后荣获市级以上科技成果奖60多项，其中国家级1项，省级12项。近年来，全院在国家级、省级以上学术刊物发表论文400余篇，先后育成小麦、水稻、玉米、油菜、大豆、红麻、紫云英等新品种50余个。